兵团残联机关内设3个处室。

1.综合处（办公室、研究室、计划财务部、人事部、兵团残疾人工作协调委员会秘书处）：综合协调重要政务、事务；负责残联工作会议的组织安排及议定事项的督办；负责信息、统计、文秘、档案、机要、保密、后勤管理等工作；承担兵团残工委秘书处日常工作。

调查研究残疾人问题及与残疾人利益密切相关的经济、政治、社会问题，研究残疾人事业发展的理论、政策，提供决策依据和建议；负责起草重要报告、领导讲话、综合性文件。

负责基层残疾人组织自身建设；协助各师党委管理师残联领导班子；联络、表彰残疾人。

编制残疾人事业发展资金计划，管理事业经费、基建投资、物资配置和机关行政经费；负责机关及所属单位国有资产管理；负责残疾人事业的科技工作；承担残联系统内部审计；统筹开展为发展残疾人事业的募捐活动；管理本级残疾人福利基金，指导基层残疾人福利基金会工作。

负责机关及直属单位的党群和精神文明建设；负责计划生育工作；承担党组有关会务和议定事项的督办工作；管理机关和直属单位的机构编制、人事和劳动工资、社会保障等工作；负责机关部（处）和所属单位的领导班子建设和干部管理工作；负责职称及工人技术等级考核报批工作；负责退休干部职工的管理工作。

2. 康复部（组联部、维权部）：组织制定和实施残疾人康复工作计划；承担兵团康复工作办公室、兵团“视觉第一中国行动”项目办公室的日常工作；指导和协调残疾人康复机构的业务工作；协调康复技术专家指导工作和康复技术服务工作；指导残疾人用品开发、供应、服务；推广高新科技成果在康复领域的应用；开展残疾预防辅导工作；组织康复人才培训。

协助有关部门研究拟定有关维护残疾人权益、发展残疾人事业的规章，配合有关方面对兵团有关优惠政策执行情况进行检查；配合有关部门做好法律工作人员的培训和普法宣传工作，为残疾人提供法律援助和服务；负责残疾人的来信来访工作；负责无障碍设施建设的推进工作。

组织制定并实施残疾人工作者培训计划；调查残疾人状况，管理和发放残疾人证；教育、培养残疾人；指导基层和社区残疾人工作，组织志愿者助残活动；指导基层残联综合服务设施建设。

3.教育就业部（宣传文体部、国际联络部）：协助有关部门制定和实施残疾人教育工作计划；促进残疾人学前教育、义务教育、职业教育、高级中等以上教育和成人教育；负责盲文、手语的推广。协助有关部门制定残疾人劳动就业工作计划；指导残疾人兴办残疾人福利企业；指导开展残疾人按比例就业工作；负责残疾人劳动服务网络的建设与工作；组织实施残疾人专项扶贫；协助有关部门开展残疾人社会保障工作。

组织制定并实施残疾人事业的宣传和文体工作计划，宣传国家、自治区、兵团发展残疾人事业的方针、政策；负责为残疾人提供特需读物和精神文化产品，推动残疾人信息交流无障碍的协调工作；开展残疾人文化、艺术活动；管理和发展残疾人体育。

承担各类残疾人专门协会的日常工作。